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説明
The codon table is represented in four different ways:
* Codon Picker -- allows you to select a particular codon to see the name and structure of the corresponding amino acid. You can see amino acid properties by clicking on the amino acid structure.
* Codon Table -- table representation of the codon table
* Codon Circle -- circular representation of the codon table (a little bit unusual, but pretty)
* Codon Alignment -- contains additional information about initiation (start) codons
===
Following information about each amino acid is provided:
* Chemical structure
* Three letter and one letter abbreviations
* All codons that encode the amino acid
* Polarity
* Side chain charge (neutral, positive, negative)
* pH (acidic or basic)
* Chemical formula of the side chain
* Aromatic or aliphatic
* Essential
* Small
* Polar
* Hydrophobic
* Hydropathy
* Molecular weight (MW)
* Isoelectric Point (pI)
* pK1 (-COOH)
* pK2 (+NH3)
* pKa
* reference to Wikipedia
====
"Amino Acid and Nucleotide Codes" reference tool contains 26 amino acid and 16 nucleotide codes (abbreviations). This includes the following non-standard/degenerate codes:
R Purine (A or G)
Y Pyrimidine (C or T)
N Any nucleotide
W Weak (A or T)
S Strong (G or C)
M Amino (A or C)
K Keto (G or T)
B Not A (G or C or T)
H Not G (A or C or T)
D Not C (A or G or T)
V Not T (A or G or C)
Asx B Asn or Asp
Glx Z Gln or Glu
Xle J Leu or Ile
Sec U Selenocysteine (UGA)
Pyl O Pyrrolysine (UAG)
Unk X Unknown
====
Amino Acid Venn Diagram shows classification of all amino acids by physical/chemical properties on a single picture.
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